Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms