Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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