Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms