Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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