Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDR42E2A6NKP2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms