Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms