Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms