Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNX13Q9Y5W8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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