Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.7 ms