Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms