Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms