Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1Q96S38 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms