Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSPG4P5Q96PW8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSPG4P5Q96PW8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSPG4P5Q96PW8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSPG4P5Q96PW8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSPG4P5Q96PW8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSPG4P5Q96PW8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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