Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms