Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms