Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms