Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEIL2Q969S2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms