Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3C3Q8NEB9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PIK3C3Q8NEB9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PIK3C3Q8NEB9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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