Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms