Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms