Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms