Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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