Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PDK4Q16654 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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