Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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