Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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