Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GBX1Q14549 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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