Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AP3B2Q13367 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms