Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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