Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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