Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SYCNQ0VAF6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SYCNQ0VAF6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SYCNQ0VAF6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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