Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms