Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-21P61565 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms