Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms