Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANGAP1P46060 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms