Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD247P20963 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD247P20963 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD247P20963 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD247P20963 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD247P20963 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD247P20963 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD247P20963 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD247P20963 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD247P20963 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD247P20963 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD247P20963 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms