Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL2P13500 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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