Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms