Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED1O96006 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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