Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms