Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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