Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA2O00451 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms