Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms