Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms