Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIGD1AQ9Y241 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms