Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6BQ9UPQ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms