Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF18Q9UNG2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF18Q9UNG2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF18Q9UNG2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms