Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL2Q9UBQ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL2Q9UBQ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL2Q9UBQ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms