Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD18Q9NS91 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms