Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG4Q9NPE6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG4Q9NPE6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG4Q9NPE6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms