Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIN28AQ9H9Z2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms